Antes de que un virus nuevo provoque un brote, una de las primeras preguntas para la investigación es cómo están construidas sus proteínas y cuáles podrían ser importantes para entrar en una célula o multiplicarse. La base de datos AlphaFold acaba de incorporar modelos computacionales de complejos de proteínas de más de 2.800 virus, con el objetivo de que esas preguntas puedan empezar a explorarse antes de una emergencia sanitaria.
Las proteínas son las piezas con las que los virus realizan sus tareas. Algunas funcionan solas y otras se unen entre sí; a esas asociaciones se las llama complejos. Conocer su forma tridimensional puede ayudar a proponer qué regiones convendría estudiar en el laboratorio para desarrollar diagnósticos, vacunas o tratamientos. No equivale a tener una respuesta médica lista, pero puede acortar la etapa inicial de búsqueda cuando aparece una amenaza.
El nuevo conjunto reúne predicciones para familias virales que incluyen virus capaces de infectar a las personas. Para producirlas, los equipos combinaron catálogos curados de proteínas virales con herramientas de inteligencia artificial que calculan formas probables y posibles uniones entre ellas. Los resultados quedan disponibles de forma abierta en la AlphaFold Database, por lo que grupos de investigación que no puedan generar estos cálculos a gran escala también pueden examinarlos y plantear experimentos.
La utilidad de estos modelos depende de hacer una distinción importante: una estructura predicha es una hipótesis detallada, no una observación directa del virus ni una prueba de cómo se comportará. Por sí sola no permite saber si una mutación volverá a un virus más transmisible o más grave, ni describe todas las interacciones con su huésped. Esas cuestiones requieren ensayos de laboratorio y otros tipos de evidencia.
La experiencia con epidemias recientes mostró que el tiempo para reunir información básica puede ser decisivo. Contar de antemano con una biblioteca amplia de modelos puede permitir a la comunidad científica comparar candidatos y decidir qué pruebas tienen mayor prioridad. El valor del recurso, por ahora, está en ordenar mejor esas preguntas: las conclusiones sobre cada virus deberán llegar de la investigación experimental.
AlphaFold Database adds viral protein complexes to support pandemic preparedness · European Molecular Biology Laboratory
AlphaFold Database; fondo de Karen Arnott/EMBL-EBI · Imagen acompañante del artículo fuente; atribución preservada · Fuente de imagen
Relacionadas por categoría
Ver mas
La cola inusual de un fago ofrece pistas sobre cómo infecta a Pseudomonas resistente
La criomicroscopía mostró una arquitectura poco común en un virus que infecta Pseudomonas aeruginosa resistente. El hallazgo aporta un mapa para estudiar cómo estos fagos reconocen bacterias.
Una IA ayuda a convertir ideas de química en pruebas para diseñar enzimas
Un sistema traduce instrucciones en lenguaje común a simulaciones y cambios candidatos para enzimas, pero sus propuestas todavía deben comprobarse en el laboratorio.
Una herramienta de edición genética mejora cambios precisos en cultivos
Un sistema experimental aumentó la eficiencia de cambios puntuales de ADN en varias plantas dicotiledóneas, incluido el tomate.
Más de la misma fuente
Ver mas
Un atlas celular muestra rutas repetibles dentro del glioblastoma
Un estudio de 12 tumores de glioblastoma halló que sus células cambian de estado siguiendo patrones espaciales repetibles, una pista para investigar por qué este cáncer es tan difícil de tratar.
Una nueva técnica permite ver cómo se ensamblan los ribosomas dentro de células humanas
Una combinación de microscopías permitió reconstruir, dentro de células humanas, etapas del ensamblaje de los ribosomas y cuestionar una idea extendida sobre ese proceso.
Un mapa más preciso muestra cómo los embriones empiezan a usar su propio genoma
Un estudio en embriones de ratón siguió con precisión el momento en que el programa genético propio reemplaza las instrucciones aportadas por el óvulo.
Más del mismo autor
Ver mas
La migración se asoció con más extinciones de ungulados a lo largo de la evolución
Un análisis de fósiles y especies actuales asocia la migración de los ungulados con un recambio evolutivo más rápido, que incluye más extinciones.
En moscas, un circuito nervioso coordina el corazón y el movimiento ante una amenaza
Un estudio en moscas de la fruta identifica neuronas que enlentecen el corazón y modulan el movimiento ante un estímulo mecánico, sin demostrar un mecanismo equivalente en humanos.
Un modelo explora cuándo los derivados del hidrógeno pueden ayudar a descarbonizar China
Una simulación del sistema energético chino estima que transportar y almacenar energía en derivados del hidrógeno puede reducir costos en usos difíciles de electrificar, bajo supuestos concretos.